神兽的分布位置是玩家关注的重点内容。火烈鸟作为火属性神兽，固定刷新在火焰山的山顶，玩家可以通过地图轻松找到该位置。需火烈鸟拥有强大的战斗能力，挑战或捕捉前需确保队伍具备足够的实力。冰神柱则出现在双子岛的滑冰场区域，玩家需按照特定滑行路线移动，途中遇到岩石需主动撞击以停止滑行，随后便能在对面发现冰神柱的身影。幽灵塔顶层的吉拉奇则需要玩家通过层层机关考验才能遇见。
三大传说鸟类在游戏中各有特定栖息地。急冻鸟位于双子岛深处，玩家需使用冲浪技能抵达后，按照正确顺序推动岩石阻挡瀑布水流才能触发捕捉事件。闪电鸟栖息在无人发电厂最深处，该区域通常需要后期技能才能进入。火焰鸟则隐藏在火焰山顶部，这个地点在游戏中期即可到达，但挑战难度较高。洛奇亚作为等级约80级的强力神兽，需要乘坐飞机前往八座彩虹岛，根据地图指引在右下角草坪区域才能遭遇，建议队伍中有三只以上高级宝可梦再尝试挑战。
凤凰出现在1号岛山顶的草丛中，需要仔细搜索才能发现。雪拉比则生活在3号岛左侧的特定森林区域，进入后需进行探索才能遇见。雷吉洛克、雷吉艾斯和雷吉斯奇鲁这三只神柱分别位于不同地点：雷吉洛克隐藏在1号岛附近的草丛中，雷吉艾斯在双子岛特定位置，雷吉斯奇鲁则靠近发电站区域。这些神兽都具有较高的隐蔽性，需要玩家耐心寻找。
游戏中的超能力系神兽也有固定出现地点。梦幻栖息在家庭洞穴最深处，这个洞穴位于红莲岛边缘，需要特殊钥匙才能进入对应楼层。代欧奇希斯则出现在诞生之岛，需要通过特定事件触发。胡地作为强力超能力系宝可梦，可由魔墙人偶进化获得，而呆壳兽则由呆呆兽进化而来，这两种进化形态在战斗中都表现优异。沙奈朵作为特攻特防出色的超能力系宝可梦，在后期区域可以捕获。
建议队伍中包含能够施加异常状态的宝可梦，如掌握催眠粉或麻痹粉的技能。同时携带足够的高级球、计时球等特殊精灵球提高捕获概率。部分神兽需要先完成剧情任务或获得特定道具才能触发出现条件，如船票、冲浪技能等。在挑战高等级神兽时，注意保存游戏进度以防意外失败。不同神兽的出现时间与天气条件也可能影响遭遇概率，需要玩家多次尝试。
