元气骑士的隐藏关卡包括溶洞、沼泽和墓穴，每个关卡都有独特的进入方式和挑战机制。溶洞关卡需要在冰雪关BOSS房间击败BOSS后解救矿工，由其打开被堵住的路进入；沼泽关卡需在森林关的奉献池投入10把红武，触发变异哥布林祭师后出现传送门；墓穴关卡则需在遗迹关BOSS房间解开棋盘谜题才能开启传送门。这些隐藏关卡的地形和敌人机制各异，例如溶洞会掉落冰刺，沼泽会减缓移动速度，墓穴则有深坑地形需要注意走位。
隐藏关卡的BOSS战有特殊机制，无伤击败可获得增益BUFF，若中途复活则会获得减益效果。溶洞关的溶洞冰虫会利用冰面地形制造障碍，攻击时需注意躲避冰锥；沼泽关的无垠黑暗之主拥有高爆发技能，需合理利用地形规避；墓穴关的守墓甲虫王攻击范围广，建议优先清理小怪再集中输出。通关所有三个隐藏关卡后可解锁成就谜中谜，奖励为特殊背景音乐混剪磁带。
溶洞关需谨慎使用爆炸武器，避免触发冰锥坠落；沼泽关建议携带免疫减速的装备或天赋，减少地形负面影响；墓穴关需备足恢复道具，因骨堆打破后可能掉落血瓶。部分角色技能可优化通关效率，例如矿工角色能直接穿越溶洞障碍，刺客的无敌技能可应对墓穴深坑地形。联机模式下分工协作能更高效应对关卡机制。
墓穴棋盘谜题需在规定时间内连接相同符文，且棋盘不能留空；沼泽关的奉献池需投入指定数量武器，红武可加速触发；溶洞关的矿工解救是必要条件，若未出现需重新进入关卡。部分版本更新后，如古大陆神器赛季曾限时开放3-6隐藏关卡，但常规版本中需以当前机制为准。
隐藏关卡的奖励包括专属磁带和成就，但需注意版本差异。例如凌波微步成就需全程不掉入墓穴深坑，笃信成就需累计献祭10把红武。部分奖励如背景音乐磁带仅限收藏，无实战加成。关卡进入概率并非100%，需多次尝试或调整难度。建议优先解锁相关天赋和角色技能，再挑战高难度隐藏内容。
