各系别的强力技能对战斗策略至关重要。火系的最强技能是暴烈燃烧，初始选择小火龙的训练师可以在七岛学习该技能；水系的高压水炮是杰尼龟路线的终极技能；草系的硬化植物则需通过妙蛙种子路线在七岛获取。电系推荐闪电（招式机25），岩系可选择岩石封杀（招式机39），毒系精灵后期能习得泥炸弹。这些技能不仅威力突出，还往往附带特殊效果或属性加成，是构建战斗体系的核心。
超能力系的精神干扰（招式机29）和幽灵系的影子球（招式机30）可通过游戏厅兑换获得，前者适合高特攻精灵，后者则对超能系有克制效果。钢系的钢铁尾巴（招式机23）同样在游戏厅兑换，格斗系必选气合拳（招式机01）。飞行系的神鸟是火焰鸟的专属技能，龙系的激鳞则是后期龙系精灵的标志性高伤技能。这些技能的学习条件和适用对象需结合精灵个体特性进行选择。
特殊属性技能中，邪恶系的啃咬适用范围广但威力中等，冰系推荐暴风雪（非直接获取需等级提升），地面系的地震（秘传机26）和格斗系的十字切（招式机08）是物理输出首选。超能系精灵还可通过升级习得精神干扰，而水系除高压水炮外，冲浪（秘传机03）兼具地图移动与战斗实用性。部分技能如破坏光线（招式机15）虽威力巨大但需承受回合限制，需谨慎搭配。
后期岛屿区域可补充关键技能，如七岛教授的三主角终极技能。一字斩（秘传机01）等地图技能虽战斗价值有限，但推进剧情必不可少。技能机04冥想可提升超能系持续作战能力，恶系的咬碎（招式机46）则能有效克制超能系对手。注意观察NPC赠送和隐藏道具，如彩虹市百货公司的技能机专柜提供多属性高阶技能补充。
技能组合需考虑属性克制链与队伍平衡，火系暴烈燃烧配合太阳光线（草系招式机22）可形成双属性压制。岩石封杀与地面系技能形成互补，精神干扰搭配影子球能覆盖多数防御弱点。建议优先培养2-3个不同属性的主力技能，再通过技能机扩展打击面。精灵进化前后的技能池差异也需纳入规划，如凯西进化后超能系技能显著增强。
实战中技能PP值与命中率同样关键，高威力低命中技能如暴风雪（70%命中）需搭配命中强化。变化类技能如电磁波（麻痹效果）和剧毒（持续伤害）在消耗战中价值突出。最终技能配置应综合精灵种族值、特性及队伍定位，例如高速精灵适合搭配先制技能，坦克型精灵则优先选择回复类技能提升生存能力。
